A Guiné-Bissau é tão rica em sítios que é considerada um verdadeiro santuário ecológico na África Ocidental. Entre estes sítios, conta-se o arquipélago dos Bijagós, um conjunto de 88 ilhas e ilhéus rodeados de mangais e palmeiras, espalhados por 2.500 km2 de Atlântico ao largo da costa da Guiné-Bissau. Um lugar mágico e selvagem, a sua rica flora e fauna inclui várias espécies de macacos, gazelas, crocodilos, golfinhos, manatins, tartarugas, aves migratórias e uma rara manada de hipopótamos que frequentam o mar.
O país possui ainda de outros sitios ricos em biodiversidade, como o Parque Natural dos Mangues do Rio Cacheu, considerado a maior formação de mangais da África Ocidental. Ou ainda o Parque Nacional de Orango, um conjunto de cinco ilhas, incluindo Orango, que é a mais verde, selvagem e maior do arquipélago.